Il Campus è situato nel comune di Peschiera Borromeo (località San Bovio).

Il complesso sorge in un area ai confini con il Parco Agricolo Sud di Milano nelle vicinanze del parco Idroscalo, in una posizione strategica rispetto alle principali vie di comunicazione e di trasporto pubblico.

L'Innovation Campus Milano è accessibile dalla Tangenziale Est attraverso la Paullese e la Rivoltana ed è connesso anche alla Bre.Be.Mi e alla T.E.M.

Si trova nelle immediate vicinanze dell'aeroporto internazionale di Linate (raggiungibile in soli 4 minuti) ed al centro di Milano (15 minuti) con bus navetta 73/.

Con i mezzi pubblici in 20 minuti da porta Venezia, grazie al passante ferroviario (linea S5 e S6), fermata Segrate FS e poi bus atm ed in 30 minuti dal Duomo al bus ATM 73/.